Decollano gli antigeni tumorali non convenzionali
Le giunzioni di splicing non canoniche tra esoni ed elementi trasponibili rappresentano una fonte di neo-antigeni ricorrenti immunogenici nei pazienti con carcinoma polmonare.
Sebbene la maggior parte degli antigeni tumorali caratterizzati siano codificati da trascrizioni canoniche (come antigeni di differenziazione o antigeni del tumore-testicolo) o mutazioni (sia mutazioni guida che passeggeri), risultati recenti hanno dimostrato che anche le trascrizioni non canoniche, inclusi RNA lunghi non codificanti ed elementi trasponibili (TE), possono codificare neo-antigeni tumore-specifici.
Qui, indaghiamo sulla presentazione e l’immunogenicità degli antigeni tumorali derivati da eventi di splicing dell’mRNA non canonico tra esoni codificanti e TE.
Confrontando il carcinoma polmonare non a piccole cellule (NSCLC) umano e diversi tessuti sani, abbiamo identificato un sottoinsieme di giunzioni di giunzione che è sia specifico del tumore, che condiviso tra i pazienti.
Abbiamo utilizzato la peptidomica HLA-I per identificare i peptidi codificati da giunzioni tumore-specifico in campioni primari di NSCLC e linee cellulari tumorali polmonari.
I peptidi ricorrenti codificati a giunzione erano immunogenici in vitro e le cellule T CD8+ specifiche per gli epitopi codificati a giunzione erano presenti nei tumori e nei linfonodi drenanti il tumore da pazienti con NSCLC.
Concludiamo che le giunzioni di giunzione non canoniche tra esoni e TE rappresentano una fonte di antigeni specifici del tumore immunogeni ricorrenti nei pazienti con NSCLC.
Decollano gli antigeni tumorali non convenzionali
La maggior parte degli antigeni tumore-specifici identificati derivano da regioni codificanti del genoma che sono mutate o sovraespresse nei tumori, ma le regioni non codificanti possono anche generare peptidi presentati con MHC-I.
Due studi in questo numero dimostrano che gli eventi di splicing dell’mRNA tra esoni ed elementi trasponibili (TE) possono codificare peptidi immunogenici che suscitano risposte di cellule T nei tumori umani e murini (topi, ratti).
Merlotti et al. ha mostrato che l’espressione di alcune giunzioni di splicing esone-TE è specifica del tumore negli esseri umani e che le cellule T specifiche per i peptidi HLA-I codificati si trovano nei pazienti con NSCLC.
Nei modelli murini, Burbage et al. scoperto che l’immunizzazione con peptidi derivati da queste trascrizioni ha rallentato la crescita del tumore e che l’istone metiltransferasi Setdb1 ha represso l’espressione di diverse giunzioni di splicing esone-TE immunogeniche.
Insieme, questi studi identificano le giunzioni di splicing esone-TE come una classe di neo-antigeni tumorali immunogenici.
Fonte: https://www.science.org/
